Başlangıçta mescit olarak yapılmış, 1747 yılında Tiryaki Hasan Paşa tarafından minber eklenerek camiye çevrilmiştir.
Yangın ve depremlerden zarar görmüştür; 1733, 1813, 1937 ve 1958 yıllarında kapsamlı onarımlar geçirmiştir.
Son cemaat yeri ve çevre duvarı 1973’te eklenmiş, iç mekan ve ahşap işleri 2002 yılında yenilenmiştir.
Camiyle beraber yapılan sıbyan mektebi zamanımıza ulaşmamıştır; hamam ise depo olarak kullanılmaktadır.
- Öne çıkan özellikleri
Ahırkapı İshak Paşa Camii olarak da bilinir.
Eğimli bir arazide inşa edilmiş, sade bir yapıdır. Moloz taşla yapılmış olup kemer ve geçiş noktalarında tuğla kullanılmıştır.
Harim alanı kare planlı ve 70 m² genişliğindedir. Merkezi kubbe, sekizgen bir kasnağa oturur. Harim duvarlarında altlı üstlü toplam sekiz pencere bulunmaktadır; alt pencereler dikdörtgen, üst pencereler sivri kemerlidir.
Mihrap alçıdan, minber ise ahşaptan yapılmıştır.
Minare, caminin kuzeybatı köşesinde yer alır; kaidesi taştan, gövdesi tuğladandır.