Medrese yapısının doğu kanadı tamamen ortadan kalkmıştır.
Günümüze yalnız batı ve kuzey duvarları ulaşmıştır.
Batı kanadının bitiminde Hicrî 1197 (1783-1784) tarihli kitabeli bir giriş açıklığı bulunmaktadır.
Külliyedeki 1990’lı yıllardaki yeniden inşa süreci sonunda cami 1990-1994 arasında yeniden yapılmıştır; medrese kalıntıları duvar seviyesinde korunmuştur.
Öne Çıkan Özellikleri:
Vefa Medresesi ve Şeyh Vefâ Medresesi adlarıyla da anılır.
Yan yana sıralanan eş büyüklükteki odaların “U” biçiminde dizilmesiyle camiyle ortak bir iç avlu oluşturacak şekilde kurgulanmıştır.
Duvar örgüsü bir sıra küfeki taşı ve iki sıra tuğla münavebesiyle, ağaç hatıllı olarak örülmüştür.
Batı duvarında mermer söveli beş pencere, kuzey duvarında alt kotta bir kapı açıklığı ve üst kotta toplam altı dikdörtgen pencere açıklığı yer alır.