تم بناء المسجد في البداية بدون قبة وبدون مئذنة بسبب الحاجة الملحة والتقليل من التكاليف، مع سقف مسطح.
في عام ۱٨٤٥، تم إضافة قبة خشبية إلى المسجد وتم تغطيته بألواح من الرصاص.
في عام ۱٨۳٦، تم إضافة مئذنة حجرية.
خلال احتلال إسطنبول (۱٩۲۳-۱٩۱٨)، استخدم القوات الفرنسية مسجد الثكنة مخزنا للذخيرة.
في ۲٨ يونيو ۱٩۱٩ دمر حريق المسجد تمامًا، بينما تضرر الحمام المجاور جزئيًا. بسبب الانفجارات التي وقعت أثناء الحريق، تعرض المسجد لأضرار كبيرة وبقيت المئذنة فقط صامدة.
خصائصه البارزة:
تم بناء المسجد في البداية بدون قبة وبدون مئذنة، وتم إضافة قبة خشبية ومئذنة حجرية في وقت لاحق.
خلال فترة الاحتلال تم استخدام المسجد كمخزن للذخيرة وتعرض لأضرار كبيرة بسبب الحريق.
تم تسجيل المسجد الذي نجا من الحريق مع مئذنته كأحد أعمال وقف السلطان محمود الثاني.