بعد زلزال عام ۱۸۹٤، تعرض المسجد والمجمع لأضرار كبيرة؛ وتم إصلاحهما في العام التالي.
بعد أن أمر مصطفى كمال أتاتورك بترميم المجمع، تم ترميمه بين عامي ۱۹٤۰ و ۱۹٤۳ بواسطة إدارة الأوقاف، وأعيد فتح المسجد للصلاة بعد تجديده.
في الفترة من ۲۰۰۷ إلى ۲۰۰۸، تم تصحيح ميلان مئذنة المسجد نحو البحر بما يتماشى مع الأصل.
خصائصه البارزة:
هذه البناية، المعروفة أيضًا باسم جامع شمس أحمد باشا وجامع كوشكنماز، هي مبنى مربع التخطيط، ذو قبة واحدة ومبني من الحجارة المقطوعة، وتلفت الأنظار بخصائصها المعمارية.
المئذنة مبنية من الحجر المقطوع وهي ذات شرفة واحدة، وتزينت درابزينات الشرفة بشبكات من الرخام.
في داخل المسجد، تم تزيين داخل القبة بأعمال قلمية ملونة، بينما المحراب مصنوع من الرخام المزخرف بالمقرنصات.
المدرسة ذات التخطيط على شكل حرف L تعمل حاليًا كمكتبة، وضريح شمس أحمد باشا يقع بجانب المسجد. بفضل تصميم المعماري سنان الفريد لفتحة التصريف، يتم تصريف مياه البحر المتسربة من الفناء إلى المسجد بشكل فعال.