التغييرات بعد البناء
في عهد السلطان محمد الثالث، تم إضافة منبر في عام ١٥٩٨ وتحويل المسجد إلى جامع.
تم ترميم المسجد في عامي ١٩٠٠-١٩٠١، وتم إصلاح السقف الخشبي في عام ١٩٧٥. كما تم الانتهاء من ترميمه في عام ٢٠٠٨ بواسطة إدارة الأوقاف.
في عام ٢٠١٥، تم تجديد مغاسل المسجد والشادر.
أبرز الخصائص
تم وضع منبر المسجد في عام ١٥٩٨ بواسطة قازقنجي (قازانجي) إلياس جيلبي.
تم بناء الهيكل بتخطيط مربع، حيث جدرانه مكونة من ثلاث طبقات من الحجر المنتظم وطبقتين من الطوب. السقف مزخرف بشريط مائل ومغطى بالقرميد. الواجهة الأمامية لمكان الصلاة الأخير المضاف لاحقا إلى مسجد حاجي إلياس ياتاغان، والتي تحتوي على طابقين، مغطاة بالخشب مما جعلها تبدو مختلفة عن باقي الواجهات.
يتم الدخول إلى الحرم من خلال باب خشبي يقع في مكان الصلاة الأخير. على جانبي الباب، يتم فصل جزء أمامه بواسطة درابزين خشبي يمتد حتى صفين من الصلاة. من الجهة اليمنى للباب، يمكن الصعود إلى المكان العلوي للصلاة عبر سلم خشبي. تحتوي هذه السلالم على تفاصيل خشبية تعود إلى فترة السلطان محمد الفاتح. تم إغلاق الجهة الأمامية للمكان العلوي للصلاة بواسطة درابزين خشبي ليصبح مكانا خاصا للنساء.
المحراب مصنوع من الرخام، ويعلوه جزء مزخرف بالمقرنصات (مصنوع على شكل قطرات). المنبر والكراسي في مسجد حاجي إلياس ياتاغان من الخشب. جميع الجدران مغطاة بالخشب حتى ارتفاع متر من الأرض.
على الجدران اليمنى واليسرى توجد ثلاث نوافذ، وعلى جدران القبلة والشمال توجد أربعة نوافذ مرتبة بشكل علوي وسفلي. جميع النوافذ ذات شكل مستطيل، والنوافذ العلوية تحتوي على أقواس مدببة. تم غلق النافذة الرابعة في الواجهة الشرقية وتحويلها إلى خزانة.
مئذنة مسجد حاجي إلياس ياتاغان مصنوعة من الحجر والطوب، وجسمها أسطواني الشكل، وهي مئذنة ذات شرفة واحدة. يتم الوصول إلى مدخل المئذنة من خلال الباب الموجود في الجدار الغربي لمكان النساء.
في الساحة، توجد أماكن للوضوء وتواليتات. كما توجد في الساحة قبر توبجو إلياس آغا، الذي تم تجديد حجره في عام ١٨٥٤، وعلى يمين المئذنة يوجد قبر ياتاغان دده.
المسجد يسمى "مسجد ياتاغان" نسبة إلى مؤسسه حاجي إلياس آغا، وكذلك بسبب أن شخصا يدعى ياتاغان دده كان يعيش في هذه المنطقة في عهد السلطان سليمان القانوني، وكان له دور في بناء نافورة ياتاغان.
