Fetihten sonraki yüzyıllarda yaşanan şiddetli depremler sonucunda cami hasar gördü, 18. yüzyıldaki bir depremde tamamen yıkıldı ve sadece minaresi ayakta kaldı.
19. yüzyılda Hisarın içinde düzensiz bir mahalle oluştu ve caminin kalıntıları yerel yapılar arasında kaldı.
1953-1958 restorasyon çalışmaları esnasında Rumeli Hisarı onarılırken, cami ihmal edilerek, cami alanı bir konser alanına dönüştürüldü.
2009-2015 yıllarında İstanbul Büyükşehir Belediyesi’nin girişimleriyle mescit restorasyon projesi Koruma Bölge Kurulu tarafından onaylandı. 2014’te başlatılan restorasyon çalışmaları 2015 sonunda tamamlandı ve cami ibadete açıldı.
- Öne çıkan özellikleri
İstanbul’un ilk camisi olarak Rumeli Hisarı’nda, eski bir sarnıcın üzerine kurulmuştur.
Rumeli Hisarı’ndaki bu yapı, Ebu’l-Feth Camii, Hisar Camii, Kale Mescidi ve Boğazkesen Fetih Mescidi olarak da bilinmektedir.
Sarnıç üzerine inşa edilen caminin, restorasyonla yeniden orijinal tasarımına sadık kalınarak inşa edilmesi sağlandı.
Uzun yıllar ihmal edilen yapı, 2015’teki restorasyon sonrasında yeniden ibadete açılarak hizmet vermeye devam etmektedir.