1890’da kilise olarak inşa edilen yapı mübadelenin ardından camiye çevrilmiştir.
Yapının doğu cephesinde, apsisin olması beklenen bölümde 1978 yılında inşa edilen betonarme cami ile bağlantıyı sağlayan bir ek yapı yapılmıştır.
Zamanla yapının cepheleri sıvanmış, köşelerde kesme taştan plastrlar eklenmiştir.
Çatı Marsilya kiremidi kaplı beşik çatı olarak yenilenmiştir.
- Öne çıkan özellikleri
Boğazköy Kilise Camii olarak da bilinen ve doğu-batı doğrultusunda T planlı yapı, bazilikal plan tipindedir. Üç neflidir ve nefler altışar adet yığma sütun ile ayrılmıştır. Sütunlar doğu-batı yönünde basık kemerler ve çelik gergilerle bağlanmıştır.
Yapının dış uzunluğu 29 metre, ana dikdörtgen kısmının eni 16 metre, narteks kısmının eni 20,80 metre ve yüksekliği 11,50 metreolup toplam taban alanı yaklaşık 485 m²dir.
Tüm cepheleri sıvalıdır ve köşelerde kesme taştan plastrlar (üç boyutlu şeklini ve taşıyıcılığını yitirmiş sütun) bulunur. Saçak altında üstü boyalı profilli bir silme dolanmaktadır. Çatı Marsilya kiremidi ile kaplanmış beşik çatı ile örtülüdür.
Giriş kısmı olan narteks, ana dikdörtgen kütleden güney ve kuzey yönlerine yaklaşık 2,40 metre çıkıntı yapmaktadır.