Da die Kuppeln der Zellen auf der rechten Seite eingestürzt waren, wurden ihre Oberseiten durchgehend mit einer Gewölbeüberdeckung geschlossen.
Ohne einen Zuweisungsbeschluss wurde sie eine Zeit lang vom Muftiat von Fatih als Korankurs für männliche Schüler genutzt.
Während dieser Nutzungsphase wurde der Revak auf der linken Seite geschlossen und in eine Küche umgewandelt.
Es wird angegeben, dass im Innenraum die Böden und Wände bis zu einer Höhe von etwa 1,50 m mit Fliesen verkleidet und die Zwischenräume der Revake mit Eisenrahmen geschlossen wurden.
Bei den letzten Katasterarbeiten wurden die Medrese und ihr Hof als getrennte Parzellen eingetragen.
Hervorstechende Merkmale:
Sie ist auch unter dem Namen Koca-Mustafa-Paşa-Medrese bekannt und befindet sich südwestlich der Koca-Mustafa-Paşa-Moschee.
Sie steht auf einer Fläche von ungefähr 9,45 × 9,15 m; auf beiden Seiten des Unterrichtsraums mit um 45 Grad gebrochenen Außenkanten befinden sich jeweils acht Zellen.
In allen Zellen gibt es Feuerstellen; jede Zelle wird durch ein unteres und ein oberes Fenster belichtet.
Es wird angegeben, dass sich in der Mitte des Hofes ein Brunnen befindet.
Wegen ihrer Bedeutung wurde sie in der Rangstufe einer „Musile-i Süleymaniye“ angesehen; auf Grundlage der in der Stiftungsurkunde für die Studenten vorgesehenen Gesamtzuwendung wird angenommen, dass sich in der Medrese wahrscheinlich 13 Studenten befanden.
In den Aufzeichnungen von 953/1546 wird angegeben, dass der Koca-Mustafa-Paşa-Komplex aus den Einheiten Moschee, Medrese, Imaret und Hankah bestand.