Medrese, XIX. yüzyılda cadde genişletme müdahalesiyle ön cephesi kesilerek biçim değiştirmiştir.
Cadde genişletme sürecinde medresenin uç kısmındaki dört hücre yıkılmış; caddeye bakan üst odalar yapılmış ve cadde kenarına düz bir duvar çekilmiştir.
Öne Çıkan Özellikleri:
Yapı, Çemberlitaş’taki Atik Ali Paşa külliyesinin medrese birimidir ve vakıf düzeni içinde dinî ilimler eksenli bir eğitim yapısı kimliği taşır.
Medrese, tam simetrik bir plana göre kurgulanmıştır; ortasında kubbeli revaklı bir avlu düzeni bulunur.
Avlu çevresinde kubbeli on altı hücre bulunduğu, günümüze bu hücrelerden on ikisinin ulaştığı kaydedilmiştir.
Dershane birimi, büyük kubbeli bir kütle olarak avlu aksında dışa taşkın biçimde düzenlenmiştir ve taş-tuğla dizileriyle inşa edilmiştir.