Yapı, 1937–1938 eğitim-öğretim yılında Türk okulu olarak “Taksim Erkek Lisesi” adıyla eğitim işleviyle kullanılmaya başlanmıştır.
Yapı, 1847’de tek kat ve iki sınıfla başlayan kütlenin zamanla iki kat daha eklenmesiyle bugünkü kat adedine ulaşmıştır.
1984 yılında, modern eğitim olanaklarına cevap vermeyen laboratuvarların yerine yeni fen laboratuvarları açılmıştır.
İstanbul Atatürk Lisesi Mezunları Vakfı tarafından okul binası kapsamlı bir onarım/yenileme sürecine alınmış; yenilenen yapı 8 Mart 2001 tarihinde yeniden eğitim-öğretime açılmıştır.
Öne Çıkan Özellikleri:
Okul, “Beyoğlu Atatürk Anadolu Lisesi”, “Taksim Erkek Lisesi”, “Beyoğlu Erkek Lisesi”, “Atatürk Erkek Lisesi” ve “Taksim Atatürk Lisesi” adlarıyla da anılmıştır.
Mevcut yapı, 1847’de “Saint Jean Baptiste Fransız Mektebi” olarak eğitime açılmış; 1937’den itibaren Türk eğitim kurumuna dönüştürülmüştür.