15 Kasım 1935 tarihli kanunla (cami tasnifine dair bir kanun) kadro dışı bırakılmış ve İstanbul Üniversitesi Kütüphanesi okuma salonu ve deposu olarak kullanılmıştır.
Kadro dışı bırakılan cami 27 Mart 1987’de tekrar ibadete açılmıştır.
17 Ağustos 1999 Gölcük depreminde hasar görmüş ve Vakıflar Genel Müdürlüğü tarafından restore edilmiştir ve 2006 yılında yeniden ibadete açılmıştır.
- Öne çıkan özellikleri
Kesme taş ve tuğla kullanılarak karma bir teknikle inşa edilmiş, dikdörtgen planlı bir yapıdır. Çatısı başlangıçta kurşun kaplı iken, sonradan kiremitle kaplanmıştır.
Minaresi kesme taştan yapılmıştır.
Etrafını çevreleyen pencereli bahçe duvarı kesme taş ve tuğla ile yapılmıştır; köşesinde beş pencereli bir sebil bulunmaktadır.
Kıble duvarının ön kısmında bir hazire bulunmakta olup, İbrahim Paşa türbesi için ayrılmış ancak kendisi Girit’te vefat ettiği için buraya defnedilememiştir.