Yapımından Sonraki Değişiklikler
Tarihi yapının bulunduğu arsada 1503-1870 yılları arasında "Develi Han" ismiyle bilinen ve konaklama işlevi gören bir hanın bulunduğu resmi kayıtlarda geçmektedir.
1875'te harabe halini alan han yıktırılarak yerine İstanbul genelinde aynı anda açılan 9 rüştiyeden biri olan "Kırk İkinci Yıl Askeri Rüştiyesi" inşa edilmiştir.
1914'te "Numune Mektebi" ve Cumhuriyet'in ilanı ile birlikte de "Fatih 28. İlkmektep" isimleriyle eğitim amaçlı kullanılmaya devam etmiştir.
1969'da kapsamlı bir restorasyona alınarak bir yıl süreyle kapatılmıştır.
1980'de korunması gerekli kültür varlığı statüsüne kavuşmuştur.
Öne Çıkan Özellikler
Okul günümüzdeki ismini, bulunduğu semte de adını veren Yavuz Sultan Selim sadrazamlarından Koca Mustafa Paşa'dan almaktadır.
Osmanlı İmparatorluğu'nda 19. yüzyılda orduyu modernleştirme çalışmaları kapsamında askeri liselere (idadi) öğrenci yetiştirmek amacıyla kurulan ara okullara rüştiye (ortaokul) ismi verilmiştir.
Osmanlı İmparatorluğu'nun son döneminde önemli roller üstlenmiş devlet adamı ve eğitimci Süleyman Hüsnü Paşa, Askeri Okullar Bakanlığı (Ders Nazırı) görevini de yürütmüş ve okulun kurulması emrini bizzat vermiştir.
Anıtsal giriş yapısı, kemerli pencere düzeni ve geometrik planı ile tipik bir 19. yüzyıl kamu/askeri yapısıdır.
Okulun ön bahçesinin altında, yangın gibi acil durumlarda su sağlaması amacıyla inşa edilmiş tarihi bir itfaiye sarnıcı yer almaktadır.
19. yüzyılda Osmanlı İmparatorluğu'nda askeri yapıların inşası için Seraskerlik İstihkam Dairesi kurulmuş; mimar, mühendis, kalfa ve ustalar tarafından kollektif olarak projelendirilen yapılar ortaya çıkmıştır.
Okulun ünlü mezunları arasında Türkiye'nin 5. Cumhurbaşkanı Cevdet Sunay, eski başbakanlardan Recep Peker ve Şemsettin Günaltay, İstanbul eski valisi ve belediye başkanı Lütfi Kırdar, sanatçı Fatma Girit, Sunay Akın ve gazeteci Doğan Hızlan gibi isimler bulunmaktadır.

