Cumhuriyetten sonra okulun adı Fener Rum Erkek Lisesi olmuştur.
Karma eğitime geçildikten sonra kız öğrenciler ana okul binasında eğitim almaya başlamıştır.
Okul, 1861’den sonra klasik eğitim veren bir lise statüsüne dönüşmüştür.
Öne Çıkan Özellikleri:
Kırmızı Okul ve Kırmızı Mektep adlarıyla anılmıştır.
Günümüze ulaşan görkemli bina, Fener sırtlarında hâkim bir tepe üzerine inşa edilmiştir.
Yapı, geniş ve yüksek cephesi, kırmızı ateş tuğlaları ve ortasındaki kubbeli kalın kulesi ile ayırt edilir.
Haliç’in iki yakasındaki yapılar içinde Süleymaniye’den sonraki en büyük yapı olarak tanımlanmıştır.
Yapı malzemelerinin çoğu Marsilya’dan getirilmiştir.
Okulun kuruluşu 1454 yılına tarihlenir; kuruluş, Fatih Sultan Mehmet’in Ortodoksların kendi dillerinde eğitim yapabilmesine ilişkin fermanı ve Patrik Gennadios ile yapılan anlaşma çerçevesinde gerçekleşmiştir.
Okul, Osmanlı döneminde baştercümanlar, Eflak ve Boğdan beyleri ile patrik ve yüksek din görevlileri yetiştiren bir kurum olarak tanımlanmıştır.
Zigomolar (baba-oğul), Teofilos Koridaleus, Aleksandros Mavrokordatos, Avgenios Vulgaris ve Konstantin Kumas okulun hocaları arasında sayılmıştır.
Yapı, büyüklüğü nedeniyle zaman zaman Fener Rum Patrikhanesi ile karıştırılmıştır.