В 1810-1811 гг. Султан Махмуд II изменил притвор мечети и перестроил минареты.
В 1823 году минареты были разрушены юго-западным ветром и в короткие сроки восстановлены.
Капитальный ремонт проводился в период с 1954-1959 по 1967 год.
В период с 1999 по 2002 год он подвергся обширной реставрации.
Хюнкар Касри в настоящее время используется как библиотека Ибрагима Хакки Коньялы.
- Примечательные особенности
Она построена в стиле барокко, а некоторые ее детали выполнены в стиле ампир.
Мечеть представляет собой центральное однокупольное сооружение, главный купол опирается на четыре большие арки, в барабане купола имеются большие окна.
Резные украшения внутри мечети, наличие суры аль-Фатх на поясе мечети относится к идеалам завоевания Селима III.