Aslen bir medrese misafirhanesi olarak inşa edilen yapı, tabhane fonksiyonunu kaybettikten sonra medrese olarak kullanılmıştır.
1766 depreminde yıkılan kubbesi, 1956’dan sonra yeniden inşa edilmiştir.
Fatih Külliyesi’nin bir parçası olarak hizmet veren yapıda, tabhanede kalanlara ve medrese öğrencilerine yemek çıkaran bir aşhane ve imaret de bulunuyordu.
Arazinin yüksek bir noktasına inşa edildiğinden, binanın altında bir kervansaray da yapılmıştır.
Günümüzde Fatih Camii Erkek Kur’an Kursu talebelerine mescit olarak hizmet vermektedir.
Cuma namazlarında halka açıktır.
1983 yılında dernek ve vakıf tarafından tamir ve ihya edilmiştir.
2014 yılında kapsamlı bir restorasyona alınmıştır.
- Öne çıkan özellikleri
Kesme taştan yapılmış sade bir mihrabı bulunmaktadır.
Minberi ahşaptır.
Dört duvarında birer pencere yer almaktadır.
Tarihi süreçte medrese, tabhane ve kervansaray olarak çeşitli işlevler görmüştür.