تعرّضت كنيسة آيا نيقولاوس الأقدم في يني كوي لحريق سنة ١٧٧٢؛ ثم أُعيد إحياؤها بين سنتي ١٨١٢ و١٨١٤، وجُدّدت إلى هيئتها الحالية في سنتي ١٨٣٨/١٨٣٩.
ويوجد في برج الأجراس نقش رخامي مؤرخ بسنة ١٨٨٨.
ومن المعلوم أن الكنيسة كانت قائمة في مرحلة أقدم في موضع مختلف، وأنها تعرضت للتخريب في منتصف القرن السابع عشر لسبب غير معروف، وأنه أُذن ببنائها في موضعها الجديد سنة ١٨٣٨ في عهد السلطان محمود الثاني.
خصائصه بارزة:
الكنيسة تابعة لبطريركية الروم في إسطنبول.
والمبنى ذو مخطط بازيليكي بثلاثة أروقة؛ وقد وُصف تنظيم الناووس والنارثكس في المصادر وصفًا مفصلًا.
وتقع الكنيسة في يني كوي على منحدر ينزل إلى جادة كوي باشي.
وفي إطار دراسة أُعدت على الأيقونات المؤرخة إلى القرنين الثامن عشر والتاسع عشر في المبنى، جرى فهرسة ثمانٍ وسبعين أيقونة منقولة.
وفي الجهة الشمالية الشرقية من الفناء يوجد قبر كونستانتينوس كاراتودوري؛ وكان قد عمل مدرسًا في المدرسة الطبية في إسطنبول، وكان طبيبًا ارتبط بدوائر القصر في ذلك العصر، بما في ذلك السلطان عبد المجيد.