1763 yılında cami, ilk ciddi onarımdan geçirilmiştir.
II. Mahmut tarafından ahşap olarak genişletilen son cemaat mahalli ve kadınlar mahfili genişletilmiştir.
1940 yılında ise minarenin yenilenmesiyle sonuçlanan geniş kapsamlı bir onarım yapılmıştır.
Modern dönemde, caminin alt katındaki tonozlu dükkân bölümü cafe-restoran olarak kullanılmaktadır.
T.C. Vakıflar Genel Müdürlüğü, Hacı Kemalettin Camii ve dükkanları için 2019 yılında restorasyon çalışmalarına başlamıştır. Restorasyon, camide taş, güçlendirme, ahşap ve minare işleri ile çevre düzenlemesi gibi çalışmaların ardından 2021 yılında tamamlanmıştır.
- Öne çıkan özellikleri
Kareye yakın planlı, fevkani (üst katlı) yapısı olan caminin duvarları taş ve tuğla örgülüdür, çatısı ahşaptan ve Marsilya kiremidi ile kaplıdır.
Yapının kuzeyinde konumlanmış tek şerefeli taştan minaresi, barok ve ampir üsluptaki rokoko süslemelerle detaylandırılmış, sütunları rokoko başlıklı bir çıkması bulunur.
Benlizade Reşit Efendi’nin 1777 tarihli çeşmesi ve arkasında namazgâh yeri bulunur.
İç mekanda vitray üst pencereler ve barok süslemeler dikkat çeker.