Более старая церковь Айя Николаос в Еникёе пострадала от пожара в 1772 году; в 1812–1814 годах она была восстановлена, а в 1838–1839 годах обновлена в своём нынешнем виде.
На колокольне имеется мраморная надпись с датой 1888 год.
Известно, что на более раннем этапе церковь находилась в другом месте, в середине XVII века была разрушена по неизвестной причине, а в 1838 году, в правление султана Махмуда II, было дано разрешение на её строительство на новом месте.
Примечательные особенности:
Церковь принадлежит Греческому православному патриархату Стамбула.
Здание имеет план трёхнефной базилики; композиция наоса и нартекса подробно описана в источниках.
Церковь расположена в Еникёе, на склоне, спускающемся к проспекту Кёйбашы.
В рамках исследования, посвящённого иконам XVIII–XIX веков, находящимся в церкви, были каталогизированы 78 переносных икон.
В северо-восточной части двора находится могила Константиноса Каратодори; он преподавал в Стамбульской медицинской школе и был врачом, связанным с дворцовым окружением своего времени, включая султана Абдул-Меджида.