Sultan I. Mahmut döneminde hünkar mahfili eklenmiştir.
15 Kasım 2020 tarihinde elektrik tesisatından kaynaklanan yangında caminin ahşap kısımları, hat ve tezhip koleksiyonları hasar görmüştür.
Kasım 2022’de başlayan restorasyon sürecinde yanan ahşaplar ve sonradan eklenen betonarme bölümler kaldırılarak yapısal güçlendirme yapılmıştır. Orijinal kalem işi süslemeler konservasyon çalışmaları sonrası yerine konulmuş, minarenin külahı yeniden yapılmıştır.
16 Haziran 2023’te Cumhurbaşkanı Recep Tayyip Erdoğan’ın katıldığı törenle yeniden ibadete açılmıştır.
- Öne çıkan özellikleri
Vani Mehmet Efendi Camii olarak da bilinen yapının tek şerefeli bir minaresi vardır ve giriş kısmı batıdandır.
Ahşap karkas yapıya sahip olan cami dikdörtgen planlıdır, duvarları kâgir ve kırma yapıdır.
Caminin deniz tarafında duvar çeşmesi bulunmaktadır, koruya bakan kısmı ise yüksek sütunlar üzerine sundurma şeklinde inşa edilmiştir.
Semte ismini veren Vani Mehmed Efendi tarafından yapılmış olup, yanına bir yalı ve medrese de inşa edilmiştir.